Типы гербариев: Занятие 1. ДЕЛАЕМ ГЕРБАРИЙ

Разнообразие и типы гербарных коллекций и их функции

В настоящее время в мире имеется предположительно около 4000 гербариев, из которых 3400 — официально зарегистрированных Комитетом по регистрации Гербариев мира в Нью-Йорке, и включенных в Index Herbariorum.

В России зарегистрировано в настоящее время около 170 Гербариев, из которых 68 расположены в 60 вузах Российской Федерации.

В зависимости от задач и возможностей, а также характера проводимой работы можно выделить гербарии общие (мировые), региональные, локальные, специальные. Общие гербарии могут быть очень крупными. Крупнейшей гербарной коллекцией в мире является Гербарий музея естественной истории в Париже (Р), в котором хранится около 10 млн образцов. Гербарий ботанического сада Кью в Лондоне насчитывает около 6,5 млн образцов. Самая большая гербарная коллекция нашей страны и одна из крупнейших в мире хранится в Ботаническом институте им. В. Л, Комарова в Санкт — Петербурге. Она насчитывает более 5 млн листов высших растений и около 1 млн — низших растений, встречающихся на территории всей России и сопредельных стран, а также в других странах мира.

Общие (или международные) гербарии — обычно очень большие коллекции, охватывающие, по возможности, исчерпывающий круг таксонов в масштабах всей Земли. Большинство общих гербариев были основаны на ранних этапах развития формальной систематики и вырастали до своих нынешних размеров в течение сотен лет. Они привлекают многочисленных посетителей и получают множество запросов на отправку материала во временное пользование, так как богаты типовыми и другими исторически важными образцами. На базе этих гербариев проводятся широкомасштабные исследования семейств и таксонов более высокого ранга, готовятся обзоры целых родов, крупные (охватывающие крупные регионы) «флоры»; национальные и локальные «флоры», составляются географические списки.

Национальные гербарии — обычно охватывают отдельные страны и сопредельные территории. Национальные гербарные коллекции могут быть достаточно старыми или современными (в зависимости от истории страны и развития науки). В них часто хорошо представлен типовой материал, особенно в отношении сравнительно недавно описанных таксонов. Национальные гербарии вносят свой вклад в создание крупных «флор» (охватывающих несколько стран), в подготовку национальных и локальных «флор», флористических списков, «Красных книг» и т. п.

Локальные гербарии — охватывают конкретные регионы в пределах страны, например, край, область, район, штат и т. д., или даже еще меньшую территорию, такую как заповедник или природный парк. Локальные гербарии обычно имеют довольно короткую историю и содержат немного типовых образцов, если вообще их имеют. В такой коллекции обычно представлены все таксоны, имеющие отношение к изучаемой территории. Локальные гербарии вносят вклад в подготовку национальных, локальных «флор» и географических списков.

Специальные гербарии — создаются с конкретной целью, часто (но не всегда) небольшие и имеют ограниченный объем. Имеется несколько типов специальных гербариев в зависимости от их функции.

— Авторские гербарии: могут храниться как отдельные блоки гербарной коллекции в пределах общего гербария (например, гербарий Н. С. Турчанинова в Киеве или гербарий Триниуса в Санкт-Петербурге и Москве) или принадлежать отдельным учреждениям (например, Линнеевскому обществу, университетам, музеям или монастырям). Они обычно расположены в своем первоначальном порядке (без изменений в соответствии с современными взглядами в систематике) и имеют ограничения в отношении консультаций и отправки материала по запросам. Поскольку они богаты типовым материалом, важнейшие исторические гербарии переснимаются на микроафиши или их электронные изображения помещаются на интернет-сайтах, что помогает решить проблему доступности этих образцов.

— Учебные гербарии: располагаются в институтах и университетах, более скромные гербарии — в техникумах, колледжах и школах (некоторые университетские гербарии являются крупными и рассматриваются как национальные или локальные). Учебные гербарии, как правило, содержат образцы для демонстрации морфологических структур, растений, составляющих природные сообщества, представителей как экономически важных видов, так и культурных растений, выращиваемых в данной местности, а также ряд образцов для демонстрации признаков семейств и родов для обучения систематике. Фактически такие гербарии представляют собой собрание своеобразных наглядных учебных пособий.

— Гербарии узкоспециализированные могут включать, например, коллекции сорных или культурных растений для специалистов по сельскому хозяйству, древесных растений-лесообразователей и лесных растений-индикаторов живого напочвенного покрова для работников лесного хозяйства или медоносов для пчеловодов. Обычно они содержат по нескольку образцов всех специализированных объектов. Гербарные коллекции растений интродуцентов могут быть хорошим дополнением к ботаническим садам, дендрариям или питомникам, особенно если там выращиваются экзотические растения.

Научный гербарий Института биологии Коми НЦ УрО РАН (SYKO)

Приказ №79 от 5.09.2017 «О Придании Научному гербарию SYKO статуса Уникальной научной установки»

Положение о Научном гербарии Института биологии Коми НЦ УрО РАН

Технологический паспорт гербария

Свод общих правил гербария

1. Название: Уникальная научная установка «Научный гербарий Института биологии Коми научного центра Уральского отделения РАН (SYKO)»

Краткое название: УНУ «Научный гербарий ИБ Коми НЦ УрО РАН (SYKO)»

2. ФИО руководителя: Патова Елена Николаевна

3. Год создания: гербарий основан в 1941 г. Статус УНУ присвоен в 2017 г.

4. Главные преимущества, возможности и основные направления исследований УНУ

   :

Основное направление исследований: Изучение биологического разнообразия сосудистых растений, мохообразных, водорослей, лишайников и грибов европейского северо-востока России

Гербарий Института биологии документирует флору, лихено- и микобиоту европейского северо-востока России.

Гербарий включает следующие коллекции:

• Сосудистые растения: более 250000 гербарных листов, из которых около 160000 доступно для пользователей. В коллекции сосудистых растений представлены изотипы и паратипы 13 видов растений, описанных с территории северо-востока европейской России.

• Мохообразные: 500 видов / 56000 гербарных образцов мхов и печеночников.

• Лишайники: 1342 вида / 22000 гербарных образцов.

• Грибы: 1100 видов макромицетов / 7000 гербарных образцов.

• Водоросли: более 1000 видов / 12000 фиксированных проб, 200 живых штаммов микроводорослей и цианопрокариот.

Научный гербарий Института биологии Коми НЦ УрО РАН основан в 1941 г. виднейшим отечественным ботаником А.И. Толмачевым. С самого основания Гербарий не имел собственного штата и являлся частью ботанических подразделений Института биологии, которыми последовательно заведовали А.А. Дедов, Н.С. Котелина, В.А. Мартыненко, С.В. Дёгтева. В настоящее время Гербарий входит в состав отдела флоры и растительности Севера Института биологии (зав. отделом д.б.н. С.В. Дёгтева).

Гербарий Института биологии зарегистрирован в международной системе Index Herbariorum под акронимом «SYKO».

http://sweetgum.nybg.org/science/ih/herbarium_details.php?irn=125073

В 2017 г. гербарий зарегистрирован в качестве Уникальной научной установки (УНУ).

http://www.ckp-rf.ru/usu/507466/

Целью Научного гербария Института биологии является проведение на основе коллекционного фонда фундаментальных и прикладных научных исследований сотрудниками, как Института биологии, так и других научных, образовательных, природоохранных и иных профильных учреждений Российской Федерации и зарубежных стран. Основная специализация Научного гербария – документация флоры споровых и сосудистых растений, лихенобиоты и микобиоты европейского северо-востока России.

Основу коллекционного фонда составляют полевые сборы с территории северо-востока европейской части России (Республика Коми, Ненецкий автономный округ, Архангельская, Вологодская, Кировская области и др.). В гербарии представлена флора, лихено- и микобиота всех зональных типов растительных сообществ европейского Севера, от полярных пустынь до южной тайги, и высотных поясов западного макросклона Урала.

Также в коллекции хранятся образцы, собранные или полученные из других регионов России и стран ближнего и дальнего зарубежья (Карелия, Ленинградская, Мурманская области, Алтай, Кавказ, Камчатка, Таймыр, Дальний Восток, Шпицберген, Швейцария, Финляндия, Швеция и др. ).

Основные задачи гербария:

– создание, хранение и систематизация коллекционных фондов по различным группам растений, мохообразных, водорослей, грибов и лишайников;

– пополнение коллекционных фондов;

– обеспечение сохранности коллекционных фондов;

– проведение работ, связанных с инвентаризацией, учетом и систематизацией коллекций сосудистых растений, мохообразных, водорослей, грибов, лишайников;

– создание электронного каталога и баз данных (БД) коллекций.

типов | Гербарий

 

Гербарий УЦР насчитывал около 406 экземпляров, являющихся типами разных сортов. Тридцать два из них являются голотипами, некоторые из них перечислены ниже на этой странице.

Тип в целом представляет собой экземпляр (или группу экземпляров), с помощью которого был определен вид. Ботанический тип мало чем отличается от стандартов мер и весов, которые хранятся с высокой безопасностью и заботой национальными правительствами и служат определением единиц длины и веса, используемых в этой стране или мире. Если образец соответствует характеристикам типа, то к образцу может быть применено научное название типа. Голотип (хол[о]-, например, целый, полный) — это единственный образец, упоминаемый в официальном опубликованном определении вида как голотип. Существуют и другие типы типов: изотип (135 в UCR), паратип (218 в UCR), топотип (8 в UCR) и котип (2 в UCR). Есть около 11 экземпляров без определенного уточнения, к какому типу они относятся. Типов больше, но эти (например, неотип, синтип, лектотип, паралектотип, гапантотип) в коллекции УЦР не обнаружены.

Изотип является дубликатом голотипа. Часто, когда образец берется с живого растения, материала достаточно, чтобы заполнить более одного листа образцов. Эти дополнительные листы называются дубликатами и обычно распространяются среди других гербариев на условиях обмена с исходным гербарием. Паратип — это дополнительный образец, указанный вместе с голотипом в официальном опубликованном описании образца. Топотип – это образец, собранный в местности, где был обнаружен голотип (и паратипы). Котип — это образец, собранный с того же растения (или организма), с которого был собран голотип. Около четверти типов имеют связанные с ними изображения. Краткое руководство по его использованию приведено после следующих списков голотипов.

Сосудистые голотипы
	Helianthella durangensis
	Сеймерия Куалана
	Salvia byeana
	Шалфей лабуфана
	Twisselmannia californica

Голотипы лишайников
	Acarospora oreophila К. Кнудсен
	Caloplaca obamae К. Кнудсен
	Желатинопсис акароспорикола Кокурк. и К. Кнудсен
	Lecanora munzii K. Knudsen & Lendemer
	Lecanora simeonensis К. Кнудсен и Лендемер
	Lepraria adhaerens К. Кнудсен, Эликс и Лендемер
	Lepraria santamonicae K. Knudsen & Elix
	Lepraria texta К. Кнудсен, Эликс и Лендемер
	Lichenostigma saxicola K. Knudsen & Kocourk.
	Sarcogyne reebiae К. Кнудсен

Страница поиска — это вход в базу данных. Для поиска текстовых полей требуется правильное написание, но не обязательная полнота в случае терминов, состоящих более чем из одного слова. Например, «Новый» в поле поиска штата будет содержать типы, собранные в «Нью-Мексико». Если имя коллекционера включает личное имя человека, использование личного имени коллекционера в поле поиска коллекционера даст вам всех коллекционеров, чьи имена включают это личное имя.

Имена некоторых коллекционеров включают только инициалы их личных имен. В этих случаях личное имя в поле поиска коллекционера не даст вам эти коллекционные экземпляры.

Поиск года точен, как и диапазон года. Обратите внимание, что при поиске по годам можно использовать либо поиск по году, либо поиск по диапазону лет, но не оба варианта одновременно.

Использование более чем одного поля поиска эквивалентно «И»: найденное должно удовлетворять всем условиям.

Вы можете указать количество отображаемых записей на странице результатов поиска от 4 до 12, установив последнее поле рядом с кнопкой «Искать».

В результатах поиска будет показана уменьшенная версия изображения, если оно связано с определенным типом. При нажатии на изображение откроется страница, относящаяся к этому образцу, с увеличенной версией изображения. Там будет ссылка на еще большее изображение этой конкретной страницы-образца, если оно доступно. Это очень большое изображение будет иметь размер от 100 до 200 мегабайт. Загрузка изображения займет некоторое время. Они чередуются. Изображение будет увеличиваться в разрешении, пока не будет полностью загружено.

На основных страницах результатов вы можете отсортировать результаты по одному из различных полей, например, коллекционеру, регистрационному номеру и т. д., щелкнув треугольники по обе стороны от имен полей в зеленом верхнем «заголовке».

 

 

Что такое типовой образец?

В соответствии с точным набором правил, установленных Международным кодексом номенклатуры водорослей, грибов и растений (ICN), научное название каждого таксона почти всегда основано на одном конкретном образце. Обычно это физический образец, который должен быть включен в исследовательскую коллекцию музея или гербария.

Типы имеют большое значение. При идентификации материала исследователь пытается применить название таксона к образцу или группе образцов, и это будет основываться на его понимании соответствующих таксонов, используя (по крайней мере) описание типа, но предпочтительно на основе изучения всех типовой материал всех соответствующих таксонов. Если таксон не назван, то ученый или другой эксперт назначает типовой экземпляр и публикует новое название и официальное описание.

Этот процесс имеет решающее значение для науки биологической таксономии и биологии в целом, и эти коллекции типов считаются основой биологических исследований.

Обозначение типов

На самом деле существует несколько классификаций типов. Вот определения некоторых распространенных типов:

• Голотип: Когда в исходном описании четко обозначен один экземпляр, этот образец известен как голотип этого вида.
• Изотип: Любой дубликат голотипа.
• Лектотип: Обозначается как тип, когда первоначальный автор не идентифицировал голотип или когда голотип утерян или уничтожен. Он выбирается из числа образцов, доступных автору оригинальной публикации.
• Синтип: Любой из двух или более экземпляров, перечисленных в исходном описании таксона, если голотип не указан.
• Изосинтип: Дубликат синтипа.
• Паратип: Образец, официально не обозначенный как тип, но указанный вместе с коллекцией типов в первоначальном описании таксона.
• Неотип: Образец, выбранный более поздним исследователем для использования вместо голотипа, когда все образцы, доступные первоначальному автору публикации научного имени, были утеряны или уничтожены.
• Топотип: Образец растения, собранный в том же месте, что и голотип, но обычно в другую дату. Топотип не имеет формального статуса.
• Котип: Термин, ранее использовавшийся для синтипа, а иногда (ошибочно) для изотипа и паратипа. Это старый термин, который широко использовался и не используется современными систематиками.

Arthur Fungarium Types

Arthur Fungarium (PUR) насчитывает около 4000 типовых образцов, из которых более 3500 в настоящее время проверены и почти 1500 изображений получены в рамках Глобальной инициативы JSTOR по растениям. Коллекция типов в PUR охватывает все 14 семейств ржавчины и 144 рода (примерно 168) с примерно 3500 представленными видами. Ниже приведены краткие сведения о наших типовых образцах для классификации типов, родов, периодов сбора и страны происхождения.

Как упоминалось выше, изотип представляет собой копию голотипа. У нас есть много изотипов в Артуре, поскольку Джордж Б. Камминс, когда писал свои различные руководства по грибкам ржавчины, консультировался с сотнями типовых образцов и был снабжен образцами многих из них. Некоторые из этих изотипов представляют собой всего лишь миллиметровые фрагменты исходной коллекции, но они все же содержат ценную информацию.

Обозначение экземпляра как голотипа, когда это явно не указано для образца, — это то, что мы делаем с оговоркой. Иногда фактический код доступа PUR указывается в публикации вида или на листе/пакете четко указывается, что он взят из коллекционного гербария. Однако чаще всего в публикации дается только информация о коллекции, поэтому фактический статус экземпляра неизвестен, известно только то, что это некоторая форма типа для этого вида.

В этих случаях присваивается статус «тип», что означает, что мы можем подтвердить, что это действительно типичный материал, но мы не уверены, является ли это голотипом, изотипом или какой-либо другой формой типа. Если у нас есть только частичная информация о коллекции, мы использовали термин «тип?» (как предложено Глобальной инициативой по растениям), что указывает на то, что образец выглядит как типовой материал, но мы не уверены.

Виды Puccinia составляют более половины известных видов ржавчинных грибов, и более половины образцов в PUR относятся к видам Puccinia. Понятно, что коллекция типа PUR в основном состоит из видов Puccinia.

Анаморфные (бесполые) роды Uredo и Aecidium составляют большую часть типов. Многие из этих видов еще предстоит отнести к их телеоморфным (половым) родам. Таким образом, типовые образцы, хранящиеся в PUR, представляют собой очень важные и информативные образцы этих видов, если они будут в центре внимания будущей номенклатурной и таксономической работы.

Большая часть шрифтовой коллекции, чуть более 80%, была собрана между 1927 и 1940 годами. Это неудивительно; поскольку таксономия стала более популярной в эту эпоху, сбор образцов и обнаружение видов стали более распространенными. В последние десятилетия это замедлилось, как и скорость открытия видов.

Кроме того, гербарию Университета Пердью часто не хватало директора или урединолога в конце 20-го и в 21-м веках. PUR значительно вырос в прошлом под руководством выдающихся урединологов. PUR насчитывает более 400 типов, для которых д-р Джозеф. К. Артур был автором или соавтором названия вида, более 400 с доктором Джорджем Б. Камминсом в качестве автора и более 200 с доктором Джо Ф. Хенненом в качестве автора. С назначением директора доктора М. Кэтрин Эме в 2012 году мы наблюдаем возрождение в приобретении дополнительных коллекций грибов ржавчины как у нее самой, так и у других учреждений. Постоянное лидерство расширит коллекцию типа PUR за счет добавления представителей более поздних видов.